1、高突变率
平均每一轮逆转录一个碱基突变
2.高复制速率
10.3x109 病毒粒子/天
3、重组
每一轮逆转录有7-30个基因组的交换
体内的HIV是彼此不同的一群病毒,全基因组中只有很少的核苷酸是保守的，是复杂的病毒群体（准种 Quasispecies）
耐药株是在病毒自发性的、高频率的基因突变中产生，在药物选择性的压力下优势复制的结果。
HIV耐药基因---检测范围全面
4大类药物全覆盖：蛋白酶抑制剂、核苷类逆转录酶抑制剂、非核苷类逆转录酶抑制剂、整合酶抑制剂。
HIV-1耐药基因检测区域为蛋白酶区(PR区)和逆转录酶区(RT区)、整合酶区(INT区)，涵盖临床4大类抗HIV-1药物(蛋白酶抑制剂PIs、核苷类NRT、非核苷类逆转录酶抑制剂NNRTI、整合酶抑制剂INSTI),共检测98个基因位点超过200种突变类型。
方法对比 | 表型耐药性检测 | 基因型耐药性检测 | |
一代测序 | 二代测序 | ||
介绍 | 检测病毒在药物存在的情况下复制和生长的能力 | 检测HIV基因组中与耐药性相关的基因突变 | |
优点 | 直接定量测定耐药性，结果容易解释，有临床临界值（Cut-off），可立即检测对新药的耐药性 | 简便、快捷、检测成本较低 | |
准确度高，性能稳定，技术成熟，是现在耐药检测金标准 | 通量高，灵敏度高，可对低载量样本检测，可检出>1%的突变株，可搭载公司其他产品测序降低成本，报告周期短，可达到2天出报告 | ||
缺点 | 操作复杂、价格昂贵、耗时长、实验条件严格。 | 不能立刻检测对新药的耐药性没有临床临界值（Cut-off） | |
灵敏度低，只能检出占病毒准种20％以上的突变株病毒载量>500-1000cp/ml | 解释结果往往困难对实验操作、生信分析技术要求高 | ||
耐药检测的意义--群体耐药监测
治疗前人群的耐药监测：在开始抗病毒治疗前进行基因型耐药检测，了解从未服用抗病毒药物、曾服用抗病毒药物如暴露前/后预防人群、母婴阻断的母亲等即将开始抗病毒治疗人群的耐药情况，可作为制定一线抗病毒治疗和暴露前/后预防用药方案等的参考依据。
获得性耐药监测：在抗病毒治疗12个月或以上的人群中进行基因型耐药检测，了解耐药突变比例和模式，分析耐药发生的影响因素，可作为选择制定二线治疗方案和制定减少耐药发生的措施提供参考依据，指导和完善公共卫生模式抗病毒治疗的程序。
婴幼儿耐药监测：在18个月龄下的新诊断婴幼儿中进行基因型耐药检测，分析HIV感染婴幼儿的HIV耐药情况可作为制一线和二线婴幼儿抗病毒治疗方案的参考依据。
传播性耐药监测：在新近感染人群中的耐药性监测，了解HIV耐药毒株传播的情况，可为制定耐药毒株传播的防控措施提供参考依据。
内容来源于：杭州广科医学检验实验室
